Les enjeux liés à la qualité de l'eau en Côtes d'Armor sont particulièrement importants, notamment dans les domaines de l'alimentation en eau potable et des activités qui s'exercent sur le littoral (tourisme, aquaculture).S'y ajoutent ceux concernant les milieux aquatiques, compte tenu des potentialités piscicoles des cours d'eau du département.
L'alimentation en eau (population et industries agroalimentaires) est assurée pour plus de 80 % à partir des eaux superficielles puisées dans les rivières ou dans les barrages réservoirs (ex : barrages départementaux du Gouët, de l'Arguenon et du Blavet). Les aspects quantitatifs sont quasi résolus grâce notamment à l'interconnexion des réseaux, les problèmes sont donc prioritairement d'ordre qualitatif. Alors que des améliorations ont été obtenues pour certains paramètres (matières organiques, phosphates) suite aux travaux d'épuration effectués par les collectivités et les industriels, on constate des teneurs en nitrates et en pesticides toujours élevées. De nombreuses actions de reconquête de la qualité des eaux ont donc été engagées dans le cadre de programmes d'actions dans les bassins versants. En outre, la mise en place de périmètres de protection des captages ont bien avancé.
Dans chacun des cas, c'est la lutte préventive contre toutes les formes de pollution qui est privilégiée.
Les indicateurs de cette thématique proposent donc une vision globale des enjeux, des actions préventives et curatives mises en place et des résultats obtenus sur l'état de la ressource.